我院幾乎與學校同步，有70多年的發展歷史，起源于學校創建時開辦的電機班。
院（系）的發展歷程
1）電機班（1946-1947）
2）電機工程科（1947-1954）
3）機電科（1954-1956）
4）電機系（1956-1959）
5）電機工程系（1959-1973）[其間：“文革”中1969年原安徽水電學院、安徽工學院、合肥工業大學三校合并，安徽水電學院發配電專業并入。1970年成立電機系與校電機廠“廠系合一”的電機大隊（系）]。
6）電機系（1973-1979）
7）電氣工程系（1979-1999）（其間：1997年原安徽工學院再度與合肥工業大學合并，安徽工學院自動化專業并入）
8）電氣工程學院（1999-2001）
9）電氣與自動化工程學院（2001-至今）
本科專業的發展
1）電機專業（1946-1954）（?？疲?/span>
2）機電專業（1954-1956）
3）礦山機電專業（1956-1959）
4）發電廠電力網及電力系統專業（1958-1963）
5）電機與電器制造專業（1959-1971）
6）工業企業電氣化及自動化專業（1963-1980）
7）電機制造專業（1971-1973）[其間：“文革”中“三?！焙喜⒑?，1970年成立了工企、電制、發配電三個專業連隊]
8）電機設計與制造專業（1973-1983）
9）發電廠與電力系統專業（1971-1980）
10）工業電氣自動化專業（1980-1999）
11）電力系統及自動化專業（1980-1999）
12）電機專業（1983-1999）
13）自動化專業（1999-至今）
14）電氣工程及其自動化專業（1999-至今）
15）生物醫學工程專業（2001-2011）
16）智能電網與信息工程專業（2016-）
17）機器人工程專業（2018-）
研究生專業的發展 碩士專業：
1）工業企業電氣化自動化（1963-1965）
2）電機與電器專業（1981-至今）[注：電機專業研究生1978年開始招生]
3）電力系統及其自動化專業（1984-至今）[注：發電廠及電力系統專業研究生1978年開始招生]
4）控制理論與控制工程專業（1981-至今）[注：工業電氣自動化專業研究生1978年開始招生]
5）電力電子與電力傳動專業（1986-至今）
6）檢測技術與自動化裝置專業（1998-至今）
7）電工理論與新技術專業（2000-至今）
8）電氣工程工程碩士專業（1998-至今）
9）控制工程工程碩士專業（2001-至今）
博士專業：
1）一級學科博士授權點：電氣工程（2006年）
2）二級學科博士授權點：電力電子與電力傳動專業（1998-至今）、電力系統及其自動化（2006年）、電機與電器（2006年）、電工理論與新技術（2006年）
博士后流動站 電氣工程（2003-至今）
省部級重點學科
1）電力電子與電力傳動（2001-至今）
2）控制理論與控制工程（2001-至今）（1994年工業自動化專業被定為部級重點學科）
國家級重點學科
電力電子與電力傳動（2002-至今）
